Date: Sun, 18 Jan 2015 22:49:10 +0000 (UTC) From: Sunpoet Po-Chuan Hsieh <sunpoet@FreeBSD.org> To: ports-committers@freebsd.org, svn-ports-all@freebsd.org, svn-ports-head@freebsd.org Subject: svn commit: r377369 - head/biology/p5-bioperl-run Message-ID: <201501182249.t0IMnAVN004240@svn.freebsd.org>
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Author: sunpoet Date: Sun Jan 18 22:49:09 2015 New Revision: 377369 URL: https://svnweb.freebsd.org/changeset/ports/377369 QAT: https://qat.redports.org/buildarchive/r377369/ Log: - Simplify Makefile - Use tab instead of space - Sort PLIST - Pass maintainership to perl@ Modified: head/biology/p5-bioperl-run/Makefile head/biology/p5-bioperl-run/pkg-plist Modified: head/biology/p5-bioperl-run/Makefile ============================================================================== --- head/biology/p5-bioperl-run/Makefile Sun Jan 18 22:49:05 2015 (r377368) +++ head/biology/p5-bioperl-run/Makefile Sun Jan 18 22:49:09 2015 (r377369) @@ -7,7 +7,7 @@ PORTREVISION= 1 CATEGORIES= biology perl5 PKGNAMEPREFIX= p5- -MAINTAINER= ports@FreeBSD.org +MAINTAINER= perl@FreeBSD.org COMMENT= Wrapper modules for common bioinformatics tools LICENSE= ART10 GPLv3 @@ -19,16 +19,15 @@ BUILD_DEPENDS= p5-bioperl>=1.6.0:${PORTS p5-XML-Twig>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-Twig \ p5-File-Sort>=0:${PORTSDIR}/misc/p5-File-Sort \ p5-Config-Any>=0:${PORTSDIR}/devel/p5-Config-Any - RUN_DEPENDS:= ${BUILD_DEPENDS} CONFLICTS= p5-bioperl-run-1.[13579]* USES= perl5 -USE_GITHUB= yes -GH_ACCOUNT= bioperl +USE_GITHUB= yes +GH_ACCOUNT= bioperl GH_COMMIT= 96ccd93 -GH_TAGNAME= ${GH_COMMIT} +GH_TAGNAME= ${GH_COMMIT} USES= perl5 shebangfix USE_PERL5= modbuild @@ -41,8 +40,6 @@ SHEBANG_FILES= scripts/bioperl_applicati OPTIONS_DEFINE= DOCS -.include <bsd.port.options.mk> - post-build: cd ${WRKSRC} && ${PERL} ./Build manifest @@ -50,11 +47,9 @@ post-install: .for i in bioperl_application_installer multi_hmmsearch panalysis papplmaker run_neighbor run_protdist ${CP} ${WRKSRC}/scripts/${i}.PLS ${STAGEDIR}${PREFIX}/bin/bp_${i} .endfor -.if ${PORT_OPTIONS:MDOCS} ${MKDIR} ${STAGEDIR}${DOCSDIR} .for doc in AUTHORS Changes INSTALL.PROGRAMS README ${INSTALL_DATA} ${WRKSRC}/${doc} ${STAGEDIR}${DOCSDIR} .endfor -.endif .include <bsd.port.mk> Modified: head/biology/p5-bioperl-run/pkg-plist ============================================================================== --- head/biology/p5-bioperl-run/pkg-plist Sun Jan 18 22:49:05 2015 (r377368) +++ head/biology/p5-bioperl-run/pkg-plist Sun Jan 18 22:49:09 2015 (r377369) @@ -4,132 +4,6 @@ bin/bp_panalysis bin/bp_papplmaker bin/bp_run_neighbor bin/bp_run_protdist -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::ESoap.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::ESoap::WSDL.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::DocSumAdaptor.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::FetchAdaptor.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::FetchAdaptor::seq.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::FetchAdaptor::species.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::GQueryAdaptor.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::LinkAdaptor.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::DB::SoapEUtilities::Result.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::Factory::EMBOSS.3.gz -%%PERL5_MAN3%%/Bio::Installer::Clustalw.3.gz 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